Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
L1td1Q587J6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.31■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
L1td1Q587J6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms