Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc3lQ4KL14 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc3lQ4KL14 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms