Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Shank3Q4ACU6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Shank3Q4ACU6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Shank3Q4ACU6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms