Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Brinp3Q499E0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Brinp3Q499E0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Brinp3Q499E0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms