Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Snx25Q3ZT31 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Snx25Q3ZT31 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms