Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ckap2Q3V1H1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ckap2Q3V1H1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ckap2Q3V1H1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms