Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ulk4Q3V129 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ulk4Q3V129 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms