Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E330034G19RikQ3UWX6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
E330034G19RikQ3UWX6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E330034G19RikQ3UWX6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
E330034G19RikQ3UWX6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E330034G19RikQ3UWX6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms