Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klhdc9Q3USL1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klhdc9Q3USL1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms