Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Fchsd2Q3USJ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Fchsd2Q3USJ8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Fchsd2Q3USJ8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms