Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Znf48Q3US17 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Znf48Q3US17 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Znf48Q3US17 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Znf48Q3US17 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Znf48Q3US17 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Znf48Q3US17 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Znf48Q3US17 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Znf48Q3US17 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Znf48Q3US17 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Znf48Q3US17 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Znf48Q3US17 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Znf48Q3US17 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Znf48Q3US17 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Znf48Q3US17 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Znf48Q3US17 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Znf48Q3US17 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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