Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Skap2Q3UND0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Skap2Q3UND0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms