Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln5Q3UMW8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cln5Q3UMW8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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