Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Washc4Q3UMB9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms