Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc33Q3ULW6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms