Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ell2Q3UKU1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ell2Q3UKU1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ell2Q3UKU1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms