Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp19Q3UJD6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp19Q3UJD6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp19Q3UJD6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms