Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc34Q3UI66 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms