Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmed8Q3UHI4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed8Q3UHI4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms