Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph3aQ3UFY4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rsph3aQ3UFY4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph3aQ3UFY4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms