Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil3Q3UFQ8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil3Q3UFQ8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil3Q3UFQ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Carmil3Q3UFQ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Carmil3Q3UFQ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Carmil3Q3UFQ8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms