Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nom1Q3UFM5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nom1Q3UFM5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms