Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cops9Q3U898 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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