Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtpbp6Q3U6U5 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtpbp6Q3U6U5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtpbp6Q3U6U5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms