Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U6N9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U6N9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3U6N9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q3U6N9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U6N9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U6N9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3U6N9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3U6N9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms