Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hectd3Q3U487 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hectd3Q3U487 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hectd3Q3U487 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms