Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tbc1d2bQ3U0J8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms