Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem88bQ3TYP4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem88bQ3TYP4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms