Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trmt1Q3TX08 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trmt1Q3TX08 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt1Q3TX08 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms