Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccndbp1Q3TVC7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccndbp1Q3TVC7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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