Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Ccdc136Q3TVA9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ccdc136Q3TVA9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc136Q3TVA9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms