Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3TTL0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3TTL0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTL0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3TTL0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q3TTL0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms