Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700066B19RikQ3TS39 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700066B19RikQ3TS39 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700066B19RikQ3TS39 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms