Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms