Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms