Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc27Q3TKY6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cwc27Q3TKY6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cwc27Q3TKY6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms