Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp39Q3TIX9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp39Q3TIX9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms