Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc69Q3TCJ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc69Q3TCJ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms