Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Jmjd8Q3TA59 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Jmjd8Q3TA59 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms