Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9Z9

Zufsp, Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZufspQ3T9Z9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZufspQ3T9Z9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZufspQ3T9Z9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms