Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VrtnQ3SYK4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VrtnQ3SYK4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms