Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Treml4Q3LRV9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Treml4Q3LRV9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms