Protein–RNA interactions for Protein: Q2VLH6

Cd163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, mousemouse

Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd163Q2VLH6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cd163Q2VLH6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd163Q2VLH6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms