Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax1Q2NKI2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vax1Q2NKI2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms