Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chrna5Q2MKA5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna5Q2MKA5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms