Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tdrd9Q14BI7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
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Tdrd9Q14BI7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
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Tdrd9Q14BI7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
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Tdrd9Q14BI7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
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Tdrd9Q14BI7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
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Tdrd9Q14BI7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tdrd9Q14BI7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tdrd9Q14BI7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms