Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpusd2Q149F1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpusd2Q149F1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpusd2Q149F1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
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