Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Spatc1Q148B6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Spatc1Q148B6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Spatc1Q148B6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Spatc1Q148B6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Spatc1Q148B6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spatc1Q148B6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Spatc1Q148B6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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