Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VgfQ0VGU4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VgfQ0VGU4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms