Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gli2Q0VGT2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gli2Q0VGT2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gli2Q0VGT2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms